Penyebab dari autoimun muncul masih diteliti oleh banyak ahli, tetapi beberapa menyatakan:
1. Kondisi infeksi kronis yang tidak sembuh sempurna.
2. Alergi kronik yang tidak dilakukan pencegahan dan perubahan pola hidup sehat.
3. Asupan makanan sehari-hari yang kurang bergizi.
4. Aktivitas fisik yang terlalu tinggi tanpa proses penyembuhan dan istirahat yang cukup.
5. Keseimbangan bakteri usus yang berantakan.
6. Infeksi virus, bakteri, atau paparan radiasi.
7. Kelainan genetik.